“DNA元件百科全書”計劃公布第三階段逾120萬個候選元件
百度百科 2021-03-08 00:11:29 2744

  中國新聞網(wǎng)北京市7月30日電 (新聞記者 孫自法)著眼于繪圖人們與小鼠基因功能性元件綜合性圖普的“DNA元件百科全書”(ENCyclopedia of DNA Elements,ENCODE)計劃,全新發(fā)布了其第三階段超出120萬只人們與小鼠身體管控遺傳基因的候選功能性元件。

  施普林格·當(dāng)然(Springer Nature)集團旗下學(xué)術(shù)刊物《自然》《自然-方法》《自然-通訊》根據(jù)全新發(fā)布的14篇畢業(yè)論文合輯,敘述了“DNA元件百科全書”第三階段發(fā)布的結(jié)果,這將為基因組構(gòu)和作用產(chǎn)生新的認知能力。

  “DNA元件百科全書”計劃于2003年運行,功能性元件就是指編號具備管控遺傳基因功效的分子結(jié)構(gòu)物質(zhì)或生物化學(xué)主題活動的DNA地區(qū)。

  在《自然》發(fā)布的一篇簡述性文章中,英國麻省大學(xué)醫(yī)科院翁志萍與同事,在“DNA元件百科全書”計劃前兩個階段上拓展提升的近6000項新試驗(4834項涉及到人們樣版,1158項涉及到小鼠樣版),以前環(huán)節(jié)的絕大多數(shù)科學(xué)研究應(yīng)用的全是實體模型細胞系,而第三階段包括了超出1369個微生物樣版來源于的503種體細胞或機構(gòu)種類。依據(jù)該計劃早已繪圖出的數(shù)百萬個元件,科學(xué)研究工作人員還創(chuàng)建一個線上申請注冊庫,里邊包括人們的小鼠的候選順式調(diào)整元件(調(diào)整基因轉(zhuǎn)錄的非編號DNA地區(qū)),遮蓋到分別基因的7.9%和3.4%。

  14篇畢業(yè)論文合集中化的別的畢業(yè)論文,運用“DNA元件百科全書”的數(shù)據(jù)表明決策一部分功能性元件功效方法的基本原理。比如,美國斯坦福大學(xué)麥克爾·斯耐德(Michael Snyder)與同事,繪圖出24種人們體細胞種類內(nèi)染色質(zhì)(DNA與蛋白質(zhì)的一氧化氮合酶)的相互影響,發(fā)覺不一樣體細胞間的染色質(zhì)環(huán)形構(gòu)造差別會危害基因的表達。

  科學(xué)研究工作人員還根據(jù)小鼠科學(xué)研究了順式調(diào)整元件在臨產(chǎn)前哺乳類動物生長發(fā)育中的緩沖作用?!蹲匀弧钒l(fā)布的3篇畢業(yè)論文報導(dǎo)了胎鼠在八大發(fā)育過程的實際信息內(nèi)容,在其中幾篇畢業(yè)論文里,科技人員的研究表明,與小鼠生長發(fā)育期內(nèi)特殊機構(gòu)中有特異性的一部分增強子元件(能提高基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)整DNA序列)同宗的人們元件,存有病癥關(guān)聯(lián)性基因遺傳基因突變的聚集。這種結(jié)果或為探尋與人們生長發(fā)育阻礙有關(guān)的調(diào)整元件打下基礎(chǔ)。

  在《自然》另外發(fā)布的一篇見解文章內(nèi)容中,麥克爾·斯耐德與同事強調(diào),操縱基因管控和作用的元件聚集編號在基因組中。但是,盡管發(fā)覺了很多這類元件,很多危害特殊體細胞種類或情況的元件仍然尚需評定。因而,在“DNA元件百科全書”計劃的第四階段,很多工作中將用于擴展剖析的體細胞種類和機構(gòu)。(完)

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